被发现名下有营业执照，现在面临退还两年工资

您可能对退还两年工资的决定感到不公。根据《中华人民共和国劳动法》第三条，劳动者享有取得劳动报酬的权利。若认为单位决定不当，可引用《劳动合同法》第八十五条，若单位未依法支付劳动报酬，劳动行政部门可责令支付，逾期不付还需加付赔偿金。您还可考虑通过法律途径，如向法院提起诉讼，维护自身合法权益。
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为确保权益，建议保留所有工作相关证据，如邮件、聊天记录、工资单等。了解并遵守劳动仲裁流程，及时申请仲裁。必要时，咨询专业律师，获取法律意见。若仲裁结果不满，可考虑法律诉讼。
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若选择仲裁，需准备劳动合同、工资条、营业执照复印件等证据。仲裁前，明确仲裁请求和事实理由。仲裁过程中，注意按时参加庭审，如实陈述，遵守仲裁庭纪律。若单位不出庭，可申请缺席裁决。